Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Plod1Q9R0E2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Plod1Q9R0E2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Plod1Q9R0E2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms