Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fhl3Q9R059 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms