Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tnnt3Q9QZ47 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tnnt3Q9QZ47 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tnnt3Q9QZ47 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tnnt3Q9QZ47 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tnnt3Q9QZ47 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tnnt3Q9QZ47 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tnnt3Q9QZ47 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tnnt3Q9QZ47 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tnnt3Q9QZ47 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tnnt3Q9QZ47 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tnnt3Q9QZ47 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tnnt3Q9QZ47 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tnnt3Q9QZ47 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tnnt3Q9QZ47 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tnnt3Q9QZ47 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tnnt3Q9QZ47 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tnnt3Q9QZ47 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms