Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phtf1Q9QZ09 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phtf1Q9QZ09 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phtf1Q9QZ09 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phtf1Q9QZ09 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Phtf1Q9QZ09 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phtf1Q9QZ09 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phtf1Q9QZ09 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phtf1Q9QZ09 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Phtf1Q9QZ09 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phtf1Q9QZ09 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phtf1Q9QZ09 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phtf1Q9QZ09 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phtf1Q9QZ09 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phtf1Q9QZ09 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phtf1Q9QZ09 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phtf1Q9QZ09 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phtf1Q9QZ09 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phtf1Q9QZ09 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phtf1Q9QZ09 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phtf1Q9QZ09 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms