Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Map1aQ9QYR6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Map1aQ9QYR6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Map1aQ9QYR6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Map1aQ9QYR6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms