Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Apbb1Q9QXJ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Apbb1Q9QXJ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Apbb1Q9QXJ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Apbb1Q9QXJ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Apbb1Q9QXJ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Apbb1Q9QXJ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Apbb1Q9QXJ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Apbb1Q9QXJ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Apbb1Q9QXJ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Apbb1Q9QXJ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Apbb1Q9QXJ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Apbb1Q9QXJ1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Apbb1Q9QXJ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Apbb1Q9QXJ1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Apbb1Q9QXJ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Apbb1Q9QXJ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Apbb1Q9QXJ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Apbb1Q9QXJ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apbb1Q9QXJ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms