Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tlr5Q9JLF7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr5Q9JLF7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr5Q9JLF7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr5Q9JLF7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms