Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Upk3aQ9JKX8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upk3aQ9JKX8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upk3aQ9JKX8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Upk3aQ9JKX8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Upk3aQ9JKX8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms