Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Habp4Q9JKS5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Habp4Q9JKS5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Habp4Q9JKS5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Habp4Q9JKS5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms