Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irx5Q9JKQ4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx5Q9JKQ4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx5Q9JKQ4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx5Q9JKQ4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms