Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pard6bQ9JK83 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pard6bQ9JK83 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pard6bQ9JK83 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pard6bQ9JK83 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pard6bQ9JK83 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms