Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nrip3Q9JJR9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrip3Q9JJR9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrip3Q9JJR9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrip3Q9JJR9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrip3Q9JJR9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrip3Q9JJR9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrip3Q9JJR9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrip3Q9JJR9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrip3Q9JJR9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrip3Q9JJR9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip3Q9JJR9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip3Q9JJR9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip3Q9JJR9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip3Q9JJR9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip3Q9JJR9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip3Q9JJR9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip3Q9JJR9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nrip3Q9JJR9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nrip3Q9JJR9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nrip3Q9JJR9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nrip3Q9JJR9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nrip3Q9JJR9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nrip3Q9JJR9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Nrip3Q9JJR9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nrip3Q9JJR9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nrip3Q9JJR9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms