Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppp1r3fQ9JIG4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms