Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klhl1Q9JI74 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhl1Q9JI74 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl1Q9JI74 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms