Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dkc1Q9ESX5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dkc1Q9ESX5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dkc1Q9ESX5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dkc1Q9ESX5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dkc1Q9ESX5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dkc1Q9ESX5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dkc1Q9ESX5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dkc1Q9ESX5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dkc1Q9ESX5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dkc1Q9ESX5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dkc1Q9ESX5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Dkc1Q9ESX5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Dkc1Q9ESX5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dkc1Q9ESX5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms