Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aff4Q9ESC8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aff4Q9ESC8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Aff4Q9ESC8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Aff4Q9ESC8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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