Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES30

C1qtnf3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf3Q9ES30 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1qtnf3Q9ES30 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C1qtnf3Q9ES30 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1qtnf3Q9ES30 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1qtnf3Q9ES30 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1qtnf3Q9ES30 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1qtnf3Q9ES30 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1qtnf3Q9ES30 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1qtnf3Q9ES30 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1qtnf3Q9ES30 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1qtnf3Q9ES30 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C1qtnf3Q9ES30 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1qtnf3Q9ES30 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1qtnf3Q9ES30 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1qtnf3Q9ES30 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1qtnf3Q9ES30 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1qtnf3Q9ES30 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1qtnf3Q9ES30 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1qtnf3Q9ES30 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms