Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aph1cQ9DCZ9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Aph1cQ9DCZ9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aph1cQ9DCZ9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms