Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xab2Q9DCD2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Xab2Q9DCD2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Xab2Q9DCD2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xab2Q9DCD2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xab2Q9DCD2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Xab2Q9DCD2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xab2Q9DCD2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xab2Q9DCD2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xab2Q9DCD2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xab2Q9DCD2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xab2Q9DCD2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xab2Q9DCD2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xab2Q9DCD2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xab2Q9DCD2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xab2Q9DCD2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xab2Q9DCD2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xab2Q9DCD2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms