Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tysnd1Q9DBA6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tysnd1Q9DBA6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tysnd1Q9DBA6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tysnd1Q9DBA6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tysnd1Q9DBA6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tysnd1Q9DBA6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tysnd1Q9DBA6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tysnd1Q9DBA6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tysnd1Q9DBA6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tysnd1Q9DBA6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tysnd1Q9DBA6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms