Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pop5Q9DB28 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pop5Q9DB28 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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