Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smdt1Q9DB10 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smdt1Q9DB10 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.9 ms