Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc89Q9DA73 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc89Q9DA73 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.4 ms