Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdzd9Q9D9M4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pdzd9Q9D9M4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pdzd9Q9D9M4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
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