Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc70Q9D9B0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc70Q9D9B0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc70Q9D9B0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc70Q9D9B0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc70Q9D9B0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc70Q9D9B0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc70Q9D9B0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc70Q9D9B0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc70Q9D9B0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc70Q9D9B0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc70Q9D9B0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc70Q9D9B0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc70Q9D9B0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.3 ms