Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PudpQ9D5U5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PudpQ9D5U5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms