Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gcc1Q9D4H2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gcc1Q9D4H2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gcc1Q9D4H2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gcc1Q9D4H2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gcc1Q9D4H2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gcc1Q9D4H2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gcc1Q9D4H2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gcc1Q9D4H2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gcc1Q9D4H2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gcc1Q9D4H2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gcc1Q9D4H2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gcc1Q9D4H2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gcc1Q9D4H2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gcc1Q9D4H2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gcc1Q9D4H2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gcc1Q9D4H2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gcc1Q9D4H2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gcc1Q9D4H2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Gcc1Q9D4H2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms