Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt20Q9D312 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt20Q9D312 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt20Q9D312 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt20Q9D312 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt20Q9D312 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt20Q9D312 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt20Q9D312 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms