Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ss18l2Q9D174 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ss18l2Q9D174 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms