Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Elp3Q9CZX0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Elp3Q9CZX0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Elp3Q9CZX0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Elp3Q9CZX0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Elp3Q9CZX0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms