Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nsfl1cQ9CZ44 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nsfl1cQ9CZ44 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nsfl1cQ9CZ44 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nsfl1cQ9CZ44 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nsfl1cQ9CZ44 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nsfl1cQ9CZ44 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nsfl1cQ9CZ44 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nsfl1cQ9CZ44 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nsfl1cQ9CZ44 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nsfl1cQ9CZ44 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nsfl1cQ9CZ44 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nsfl1cQ9CZ44 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nsfl1cQ9CZ44 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nsfl1cQ9CZ44 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nsfl1cQ9CZ44 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nsfl1cQ9CZ44 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms