Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYR0

Ssbp1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp1Q9CYR0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssbp1Q9CYR0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp1Q9CYR0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms