Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Utp23Q9CX11 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Utp23Q9CX11 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Utp23Q9CX11 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Utp23Q9CX11 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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