Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NmbQ9CR53 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NmbQ9CR53 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NmbQ9CR53 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NmbQ9CR53 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NmbQ9CR53 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NmbQ9CR53 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NmbQ9CR53 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NmbQ9CR53 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NmbQ9CR53 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NmbQ9CR53 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NmbQ9CR53 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NmbQ9CR53 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NmbQ9CR53 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NmbQ9CR53 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms