Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp5f1Q9CQQ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp5f1Q9CQQ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp5f1Q9CQQ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp5f1Q9CQQ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms