Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed6Q9CQG0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms