Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ubl4bQ9CQ84 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ubl4bQ9CQ84 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ubl4bQ9CQ84 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
Ubl4bQ9CQ84 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Ubl4bQ9CQ84 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Ubl4bQ9CQ84 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ubl4bQ9CQ84 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Ubl4bQ9CQ84 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Ubl4bQ9CQ84 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Ubl4bQ9CQ84 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Ubl4bQ9CQ84 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ubl4bQ9CQ84 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ubl4bQ9CQ84 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ubl4bQ9CQ84 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ubl4bQ9CQ84 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Ubl4bQ9CQ84 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Ubl4bQ9CQ84 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Ubl4bQ9CQ84 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ubl4bQ9CQ84 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Ubl4bQ9CQ84 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Ubl4bQ9CQ84 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ubl4bQ9CQ84 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ubl4bQ9CQ84 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Ubl4bQ9CQ84 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Ubl4bQ9CQ84 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Ubl4bQ9CQ84 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ubl4bQ9CQ84 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ubl4bQ9CQ84 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ubl4bQ9CQ84 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ubl4bQ9CQ84 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ubl4bQ9CQ84 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ubl4bQ9CQ84 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ubl4bQ9CQ84 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Ubl4bQ9CQ84 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Ubl4bQ9CQ84 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Ubl4bQ9CQ84 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Ubl4bQ9CQ84 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ubl4bQ9CQ84 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ubl4bQ9CQ84 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ubl4bQ9CQ84 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ubl4bQ9CQ84 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ubl4bQ9CQ84 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Ubl4bQ9CQ84 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Ubl4bQ9CQ84 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ubl4bQ9CQ84 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ubl4bQ9CQ84 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ubl4bQ9CQ84 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ubl4bQ9CQ84 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ubl4bQ9CQ84 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ubl4bQ9CQ84 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ubl4bQ9CQ84 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ubl4bQ9CQ84 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ubl4bQ9CQ84 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
Ubl4bQ9CQ84 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
Ubl4bQ9CQ84 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ubl4bQ9CQ84 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Ubl4bQ9CQ84 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Ubl4bQ9CQ84 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ubl4bQ9CQ84 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ubl4bQ9CQ84 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Ubl4bQ9CQ84 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ubl4bQ9CQ84 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ubl4bQ9CQ84 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ubl4bQ9CQ84 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ubl4bQ9CQ84 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ubl4bQ9CQ84 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ubl4bQ9CQ84 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ubl4bQ9CQ84 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ubl4bQ9CQ84 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ubl4bQ9CQ84 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ubl4bQ9CQ84 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
Ubl4bQ9CQ84 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ubl4bQ9CQ84 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ubl4bQ9CQ84 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Ubl4bQ9CQ84 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Ubl4bQ9CQ84 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Ubl4bQ9CQ84 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Ubl4bQ9CQ84 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Ubl4bQ9CQ84 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Ubl4bQ9CQ84 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Ubl4bQ9CQ84 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms