Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mrpl49Q9CQ40 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl49Q9CQ40 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl49Q9CQ40 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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