Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ3

Uncharacterized protein C1orf185 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPZ3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CPZ3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Q9CPZ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q9CPZ3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CPZ3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CPZ3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CPZ3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CPZ3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CPZ3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q9CPZ3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CPZ3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CPZ3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CPZ3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CPZ3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CPZ3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CPZ3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CPZ3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CPZ3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CPZ3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CPZ3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CPZ3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CPZ3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CPZ3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CPZ3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CPZ3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CPZ3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q9CPZ3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CPZ3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CPZ3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CPZ3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CPZ3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CPZ3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CPZ3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q9CPZ3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CPZ3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CPZ3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CPZ3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CPZ3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CPZ3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CPZ3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CPZ3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CPZ3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CPZ3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CPZ3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms