Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rwdd4Q9CPR1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rwdd4Q9CPR1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd4Q9CPR1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rwdd4Q9CPR1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rwdd4Q9CPR1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd4Q9CPR1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd4Q9CPR1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd4Q9CPR1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd4Q9CPR1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd4Q9CPR1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd4Q9CPR1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd4Q9CPR1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms