Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a6dQ99N07 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a6dQ99N07 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6dQ99N07 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1062.2 ms