Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pls3Q99K51 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pls3Q99K51 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms