Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfxn1Q99JR1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfxn1Q99JR1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfxn1Q99JR1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfxn1Q99JR1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfxn1Q99JR1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfxn1Q99JR1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfxn1Q99JR1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfxn1Q99JR1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfxn1Q99JR1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfxn1Q99JR1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfxn1Q99JR1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfxn1Q99JR1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfxn1Q99JR1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfxn1Q99JR1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfxn1Q99JR1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfxn1Q99JR1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms