Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhl22Q99JN2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl22Q99JN2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl22Q99JN2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms