Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smc1bQ920F6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smc1bQ920F6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smc1bQ920F6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smc1bQ920F6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smc1bQ920F6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smc1bQ920F6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smc1bQ920F6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smc1bQ920F6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smc1bQ920F6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Smc1bQ920F6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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