Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Basp1Q91XV3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Basp1Q91XV3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Basp1Q91XV3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms