Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Itm2cQ91VK4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itm2cQ91VK4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Itm2cQ91VK4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itm2cQ91VK4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itm2cQ91VK4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms