Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cul7Q8VE73 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cul7Q8VE73 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cul7Q8VE73 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cul7Q8VE73 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cul7Q8VE73 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cul7Q8VE73 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cul7Q8VE73 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cul7Q8VE73 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cul7Q8VE73 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cul7Q8VE73 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cul7Q8VE73 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cul7Q8VE73 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Cul7Q8VE73 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cul7Q8VE73 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Cul7Q8VE73 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cul7Q8VE73 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cul7Q8VE73 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cul7Q8VE73 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cul7Q8VE73 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cul7Q8VE73 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cul7Q8VE73 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cul7Q8VE73 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Cul7Q8VE73 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cul7Q8VE73 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cul7Q8VE73 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cul7Q8VE73 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cul7Q8VE73 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cul7Q8VE73 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cul7Q8VE73 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cul7Q8VE73 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cul7Q8VE73 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cul7Q8VE73 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cul7Q8VE73 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cul7Q8VE73 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cul7Q8VE73 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cul7Q8VE73 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cul7Q8VE73 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 554.3 ms