Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE11

Mtmr6, Myotubularin-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr6Q8VE11 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtmr6Q8VE11 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mtmr6Q8VE11 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mtmr6Q8VE11 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtmr6Q8VE11 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtmr6Q8VE11 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtmr6Q8VE11 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtmr6Q8VE11 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms