Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc6a20aQ8VDB9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc6a20aQ8VDB9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms